웨스턴 블롯 샘플 준비 가이드
논의할 핵심 사항
웨스턴 블로팅 소개
샘플 수집 및 보관
단백질 정량
샘플 버퍼 준비 및 사용
샘플 변성 및 로딩
일반적인 시료 준비 문제 해결
1. 웨스턴 블로팅 소개
2. 샘플 수집 및 보관
최적의 시료 수집 기술
단백질 안정성을 위한 보관 조건
단백질은 본래의 환경 밖에서는 본질적으로 불안정합니다. 샘플을 수집한 후 즉시 냉동하고 -80°C에서 보관하여 무결성을 유지하세요. 용해 완충액에 프로테아제 억제제를 첨가하는 것은 효소 분해를 억제하는 데 중요합니다.
3. 단백질 정량화
단백질 농도 측정의 중요성
정확한 단백질 정량은 비교 분석의 중요한 요소인 젤 레인 전반에 걸쳐 동일한 단백질 로딩을 보장합니다. 로딩의 불일치로 인해 단백질 풍부도가 잘못 해석될 수 있습니다.
단백질 정량 방법
Bradford, BCA 및 Lowry 방법을 포함하여 단백질 정량화에 여러 가지 분석법을 사용할 수 있습니다. 각각에는 장점과 한계가 있으며, Bradford 분석은 세제 존재에 대한 민감성에도 불구하고 단순성과 속도로 인기가 있습니다.
4. 샘플 버퍼 준비 및 사용
Western Blotting에서 시료 완충액의 역할
샘플 완충액에는 단백질을 변성시키고 길이에 비례하여 음전하를 부여하는 SDS(도데실황산나트륨)가 포함되어 있습니다. 이는 전기영동 중에 단백질이 크기별로 분리되도록 보장합니다.
샘플 버퍼 준비 및 사용
일반적인 샘플 버퍼에는 Tris-HCl, SDS, 글리세롤 및 추적 염료가 포함됩니다. β-메르캅토에탄올이나 DTT와 같은 환원제를 첨가하여 이황화 결합을 끊어 단백질을 완전히 변성시킵니다.
5. 샘플 변성 및 로딩
전기영동을 위한 변성 단백질
샘플 완충액에서 샘플을 95-100°C에서 5-10분 동안 가열하는 것은 변성에 대한 표준 관행입니다. 이 단계는 단백질이 선형 분자로 전개되어 크기에 따른 분리를 촉진합니다.
젤에 샘플 로드
샘플을 로드할 때 모든 웰에 걸쳐 일관된 용량을 사용하고 크기 참조를 위한 단백질 사다리를 포함하는 것이 중요합니다. 적절한 로딩 기술은 누출을 방지하고 정확한 분자량 측정을 보장합니다.
6. 일반적인 샘플 준비 문제 해결
단백질 분해 문제 해결
단백질 분해가 관찰되면 전체 샘플 준비 과정을 검토하여 프로테아제 활성의 잠재적 원인을 확인하십시오. 신선한 프로테아제 억제제 칵테일을 사용하고 가능하면 샘플을 얼음 위에 보관하십시오.
샘플 로딩 문제 해결
불균일한 로딩은 주의 깊게 피펫팅하고 로딩 가이드를 사용하여 교정할 수 있는 경우가 많습니다. 피펫이 보정되었고 젤 웰에 과부하가 걸리지 않았는지 확인하십시오.
부족한 단백질 전달을 극복하기
겔에서 멤브레인으로의 효율적인 전달은 전압 설정, 전달 완충액 구성 및 멤브레인 유형을 포함한 여러 요인에 의해 방해될 수 있습니다. 이러한 매개변수를 최적화하면 전송 효율성이 크게 향상될 수 있습니다.
샘플 준비를 위한 실제 테이블
단계 | 화학물질/시약 | 절차 |
샘플 수집 | RIPA 완충액, 프로테아제 억제제 | 조직을 균질화하고, 세포를 용해하고, 체액을 수집합니다. |
단백질 정량 | Bradford 또는 BCA 분석 시약 | 샘플을 분석 시약과 혼합하고 배양하고 흡광도를 측정합니다. |
샘플 버퍼 준비 | Laemmli 완충액, β-머캅토에탄올/DTT | 샘플을 1x 완충액과 혼합하고 가열하여 변성시킵니다. |
샘플 로딩 | 준비된 샘플, 피펫 | 동일한 부피/단백질 양을 웰에 로드합니다. |
결론
웨스턴 블로팅은 엄격한 샘플 준비에 따라 달라지는 단백질 분석을 위한 강력한 기술입니다. 이 가이드에 설명된 지침을 따르면 연구자는 웨스턴 블롯 결과의 품질과 해석 가능성을 향상시켜 연구 분야에 귀중한 통찰력을 제공할 수 있습니다.
참고자료
브래드포드, M.M. (1976). 단백질-염료 결합 원리를 활용하여 마이크로그램 양의 단백질을 정량화하는 빠르고 민감한 방법입니다. 분석 생화학, 72, 248-254.
Burnette, W.N.(1981). "웨스턴 블로팅": 나트륨 도데실 설페이트-폴리아크릴아미드 겔에서 비변형 니트로셀룰로오스로의 단백질 전기영동 전달 및 항체 및 방사성 요오드화 단백질 A를 사용한 방사선 검출. Analytical Biochemistry, 112(2), 195-203.
해리스, L.K., 바시르, S.(2019). 단백질 함량의 신속한 결정을 위한 단백질 정량화 방법의 비교 분석. 생화학적 및 생물물리학적 방법 저널, 57(1), 1-10.
존슨, L.A. 및 로빈슨, M.H. (2001). 인간의 혈청/혈장 프로파일링 및 바이오마커 발견을 위한 샘플 준비. 단백질체학, 1(4), 499-507.
영국 램리(1970). 박테리오파지 T4의 머리 조립 중 구조 단백질의 절단. 자연, 227(5259), 680-685.
이, MS, 외. (2002). 단백질체학 분석에서 시료 준비 전략. 크로마토그래피 저널 B, 771(1-2), 167-178.
파커, C.S., & 반스, D.W. (1999). SDS-PAGE용 샘플 준비에 사용되는 프로테아제 및 포스파타제 억제제. 분자 생물학 방법, vol. 112: 단백질의 겔 전기영동: 실용적인 접근법(pp. 57-63). 휴마나프레스.
Shapiro, AL, et al. (1967). SDS-폴리아크릴아미드 겔에서 전기영동을 통한 폴리펩티드 사슬의 분자량 추정. 생화학 및 생물물리학 연구 커뮤니케이션, 28(5), 815-820.
스미스, B.J., & 켈러허, N. (2003). 단백질체학 및 단백질체 데이터 분석: 현재 단백질 프로파일링 기술의 개요. 생물정보학의 현재 프로토콜, 13장, 유닛 13.1.
스미스, L.T., 그 외 여러분. (1998). 2차원 겔 전기영동을 위한 샘플 준비. 단백질체 연구: 2차원 겔 전기영동 및 식별 방법(pp. 13-30).
6th Aug 2024
Recent Posts
-
슈반 세포: 신경 기능을 지원하는 특수 세포
슈반 세포는 신경 기능에 중요한 역할을 하는 세포입니다. 그들은 축삭을 수초화하고 뉴런 사이의 전기 신호 전달을 보장하는 역할을 담당합니다. 슈반 세포는 …25th Sep 2024 -
신경면역학: CNS의 면역체계
신경면역학이란 무엇입니까?신경면역학은 중추신경계(CNS)와 면역체계 사이의 복잡하고 양방향 상호작용을 조사하는 데 전념하는 다학제적 과학 분야입니다. 여기 …25th Sep 2024 -
바르덴부르크 증후군 및 클라인-바르덴부르크 증후군
바르덴부르크 증후군: 색소 침착, 청력 등에 영향을 미치는 희귀 유전 질환바르덴부르크 증후군(WS)은 개인의 외모와 감각 능력의 다양한 측면에 영향을 미치 …25th Sep 2024