흐름 세포 측정 (Flow Cytometry) 프로토콜 | 10가지 힌트 & 팁

유동 세포 측정 프로토콜


의미는 다음과 같다:

Flow = 동작 중, Cyto = 셀, Metry = 측정.

Flow Cytometry란 무엇인가?

Flow cytometry은 유체 흐름에서 세포의 특성을 측정한다. 복잡한 세포 시스템(예: 혈액)의 단일 세포 분석을 매우 신속하게(100s 세포/초) 수행할 수 있으며, 크기, 입자도, 세포당 형광 강도와 같은 다양한 세포 특성을 살펴볼 수 있습니다.

Flow Cytometry는 세포 계수, 세포 정렬, 바이오마커 검출 및 단백질 공학에 사용될 수 있다. 세포 구성요소는 형광 라벨링되고 레이저에 의해 여기되어 다양한 파장에서 빛을 방출한다. 흐름 세포 측정 결과를 통해 활성화된 세포 또는 활성화된 경로가 여러 개인지 정확히 파악할 수 있습니다.

흐름 세포 측정에서 선택할 수 있는 두 가지 파라미터의 예로는 전방 산란(FSC)과 측면 산란 채널(SSC)이 있습니다. FSC의 강도는 입자 크기와 관련이 있으며 세포 잔해와 살아있는 세포를 구별하는 데 사용될 수 있다. SSC는 입자의 입자 함량에 대한 정보를 제공한다. FSC와 SSC는 모든 입자에 대해 고유하며 서로 다른 셀 유형을 구별하는 데 사용할 수 있습니다.

유동 세포 측정 프로토콜

아래에는 플로우 사이토메트리 실험을 위한 힌트와 팁 외에 2개의 샘플 플로우 사이토메트리 프로토콜이 있습니다

유동 세포 측정 프로토콜 1

흐름 세포 측정 샘플 고정을 위한 이 프로토콜은 세포 주기 분석 및 DNA 라벨링을 위해 세포를 준비하는 빠른 프로토콜이다. 이 프로토콜은 세포 주기(요오드화 프로피듐으로 염색한 경우 Cell Cycle), G1, S 및 G2/M)의 위상을 측정하는 데 도움이 됩니다.

용액 및 시약

  • 피펫
  • 팁들
  • 에탄올
  • RNAse
  • PBS
  • Propidium iodine
  • 그리고 물론 혈류 세포계도 있습니다.

흐름 세포 측정 검체 고정

  1. 270 x g에서 5분간 원심분리하여 처리된 검체로부터 K562 세포를 채취하여 세포를 펠릿 처리합니다
  2. 펠릿을 방해하지 않고 상등액을 조심스럽게 흡입하십시오.
  3. 펠릿을 얼음-냉인산염 완충 식염수(PBS)로 세척한다
  4. 270 x g에서 5분간 원심 분리하십시오.
  5. PBS 200 µl에 있는 셀을 다시 일시 중단합니다
  6. 샘플 분석에 앞서 밤새 4°C에서 배양하기 전에 얼음으로 찬 에탄올(70%(v/v)) 2ml를 추가합니다.

형광 DNA 염색

  1. 고정 시료를 270 x g에서 5분간 원심분리한다.
  2. 에탄올을 흡입한 후 PBS 500µl에 다시 담급니다
  3. RNase A(30 mg/ml)와 프로피듐 요오드화물(300 µM)을 넣고 섞는다.
  4. 시료를 37 °C에서 30분간 배양한 후 분석한다.
  5. Cell Cycle Profile은 COLTER© EPICS© XL-MCL Flow Cytometer를 사용하여 분석되었습니다

유동 세포 측정 프로토콜 2

이 프로토콜 Flow cytometry는 CXCR4와 같은 수용체의 세포 표면 발현에 대한 특정 처리의 효과를 결정하는 데 사용되었다.

용액 및 시약

  • 피펫
  • 팁들
  • RPMI + 0.5% BSA.
  • 100 ng/ml SDF-1α
  • Phycoerythirin (PE) 방출 항체

  • 에탄올
  • RNAse
  • PBS
  • 유동 세포계.

흐름 세포 측정 검체 고정

  1. 5 x 105 세포/ml의 Jurkat T 세포와 혈청은 혈청 프리 RPMI + 0.5% BSA 실험 전 2시간 동안 굶는다.
  2. 불연속 교반 조건에서 100 ng/ml SDF-1α로 셀 자극
  3. 벤치탑 원심분리기에서 850 xg에서 30초 동안 원심분리를 통해 활성화를 중지합니다
  4. 얼음처럼 차가운 PBS로 세포 세척
  5. 1% BSA/PBS에서 세포 표면 수용체에 대한 피코에리티린(PE) 표지 항체로 염색하고 얼음에서 30분간 배양한다.
  6. 1% BSA/PBS로 두 번 세척
  7. 얼음 위에 1% PFA를 고정하세요
  8. 4°C에서 최대 24시간 동안 보관하거나 유동 세포 측정법으로 즉시 분석합니다.

형광 DNA 염색

CXCR4와 같은 수용체의 세포 표면 발현은 DAKO CyAn ADP(Advanced Digital Processing)로 측정되었다

결과는 히스토그램을 생성하기 위해 관련 Dako Summit(버전 4.3) 소프트웨어를 사용하여 분석되었다. 데이터는 통계 분석을 거쳐 그래프 패드 프리즘을 사용하여 그래프화되었다.

흐름 세포 측정 힌트 및 팁

1. 시료 준비

이것이 당신의 실험의 시작이고 가장 중요한 부분입니다. 부착된 세포를 사용하든 조직에서 파생된 세포를 사용하든 검체 준비가 완전히 최적화되었는지 확인합니다. 세포가 올바르게 수확되지 않으면 세포 생존 능력이 저하될 수 있습니다. 또한 효소 절차의 사용은 연구 중인 마커의 발현에 어떠한 영향도 미치지 않아야 한다.

2. 고정 및 침투 시약

모든 고정 및 투과성 솔루션이 모든 실험 환경에서 작동하는 것은 아니며 검사 중인 항원에 따라 달라질 수 있습니다.

3. 당신이 선택한 형광색소

형광색소를 선택하기 전에 고려 중인 형광색소의 레이저, 필터 및 방출 스펙트럼 특성을 알아야 합니다. 또한 사용할 계측기의 기능을 알고 있어야 합니다. 어떤 두 세포계도 그들의 능력이 같지 않다. 지식이 풍부한 직원이 있는 플로우 사이토메트리 코어를 가지고 있다면, 그들이 가장 좋아하는 4, 5, 6색 패널이 무엇인지 반드시 물어보십시오. 또한 특정 기기에서 특정 색상의 한계가 무엇인지 알려줄 수 있어야 합니다. 항상 밝은 형광색소를 선택하여 낮은 밀도로 발현되는 항원을 탐지하고 어두운 형광색소를 선택하여 높은 밀도로 발현되는 항원을 탐지해야 합니다. 형광색소의 선택은 보상에도 중요하며, '밝은' 형광색소가 스펙트럼 중복 문제를 일으킬 가능성도 고려해야 한다.

4. 올바른 컨트롤 선택

모든 실험과 마찬가지로 관리의 선택은 검사가 올바르게 작동하는지 여부를 결정하고 결과의 필수적인 부분을 형성할 수 있기 때문에 매우 중요합니다. 다음과 같은 유형의 컨트롤을 워크플로에 통합하는 것이 좋습니다:

  1. 계측기 전압 게인 및 보정을 올바르게 조정하는 데 사용되는 설정 또는 계측기 컨트롤
  2. 특정 바인딩과 비특정 바인딩을 구별하는 데 사용되는 게이트 컨트롤
  3. 생물학적으로 의미 있는 정보를 제공하기 위한 실험적 통제

아래 표에는 위의 세 가지 범주 각각에 관련된 적절한 컨트롤이 나열되어 있습니다:

Control 사용하다

얼룩이 없는 셀

배경 및 자동 형광 결정을 위한 음의 제어, PTM 전압 설정

완전히 염색된 세포

PTM 전압 설정을 통해 스케일이 잘못된 이벤트가 있는지 점검하십시오

단일 형광 마커로 얼룩진 셀 샘플/비즈

보정, 게이트 - 분석에서 비특이적 얼룩 제거

아이소타입 제어

게이트 – 분석에서 비특이적 얼룩 제거

형광 마이너스 1(FMO) 염색

게이트 – 형광 스필오버 감소

자극을 받지 않은 샘플 또는 처리되지 않은 검체

실험 음성 제어

양성 세포(자극)

실험적 양성 대조군

요오드화 프로피듐과 같은 생존 가능성 염료로 염색된 세포

생존 가능한 세포와 생존 불가능한 세포 구별

5. 죽은 세포를 식별합니다

가능하면 죽은 세포를 식별하고 제거하는 것이 특정한 얼룩을 줄이는 데 도움이 될 수 있다. 죽은 세포는 막의 완전성을 상실한 세포를 투과하는 DNA 염료를 사용하여 검출될 수 있다.

6. 식별 및 doublets 이탈

Doublets은 두 개의 세포가 서로 붙어 하나로 분석될 때 발생한다. 이는 레이저 질문 지점을 통과하는 '셀'의 형광 강도를 거짓으로 증가시킬 것이다. 게이트 아웃은 순방향 산포 INT 대 순방향 산포 Time-of-Flight(ToF) 또는 측면 산포 INT 대 측면 산포 비행 시간(ToF)을 사용하여 창을 만들어 두 배로 증가합니다. 이후, 세포 덩어리를 제외하기 위해 분석하기 전에 세포를 여과한다.

7. 샘플 보관

이상적인 세계에서는 샘플을 즉시 분석해야 하지만 항상 그렇게 되는 것은 아닙니다. 샘플을 즉시 분석할 수 없는 경우에는 100µl의 고정제(예: 1-2% 포름알데히드)를 사용하여 최대 24시간 동안 빛으로부터 보호된 상태로 4°C에서 보관하십시오.

8. 형광 신호 노이즈 감소

유동 세포 측정 실험의 최적화 중 중요한 단계는 시약(항체) 적정이다. 이것은 배경을 최소화하면서 형광 신호의 특이성과 강도를 향상시키는 데 도움이 될 것이다.

9. 형광 신호 노이즈 감소

유동 세포 측정 실험의 최적화 중 중요한 단계는 시약(항체) 적정이다. 이것은 배경을 최소화하면서 형광 신호의 특이성과 강도를 향상시키는 데 도움이 될 것이다.

10. 빛의 열화로부터 항상 보호할 것

주변 빛에 의한 형광색소 열화를 방지하기 위해 착색되었거나 착색 중인 셀이 들어 있는 플레이트 또는 튜브는 샘플을 호일 또는 다른 차광 메커니즘으로 덮어서 보호해야 합니다

Written by Sean Mac Fhearraigh

Seán Mac Fhearraigh PhD is a co-founder of Assay Genie. Seán carried out his undergraduate degree in Genetics at Trinity College Dublin, followed by a PhD at University College Dublin. He carried out a post-doc at the Department of Genetics, University of Cambridge. Seán is now Chief Technical Officer at Assay Genie.

추가 리소스



29th Jun 2023 Rithika Suresh, MSc

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